„Grand Theft Auto 3D“ yra GTA III modifikacija, kuria siekiama atkurti, kaip žaidimas atrodė prieš jo išleidimą. Naudodama ankstyvąsias ekrano kopijas, Alpha Mines ir išankstinį žaidimo eigą, komanda arba modifikatoriai praleido daugiau nei ketverius metus kurdami šią ankstyvąją GTA III versiją. Po šio ilgo kūrimo ciklo modifikacija pagaliau buvo išleista sausio pradžioje. Modifikacija veikia su PC GTA III versija. Šią GTA III versiją iš pradžių planuota išleisti PS2 ir Dreamcast platformoms. Modifikavimo komanda norėjo įtraukti kuo daugiau ankstyvojo kūrimo išteklių, net papildydama pradinį HUD. Liberty City išplanavimas taip pat labai skiriasi. Daugelio pastatų trūksta, jų vietoje – siauresnės konstrukcijos ar žolė. Bendras meno stilius yra spalvingesnis ir panašus į senesnius GTA palikuonių pavadinimus.
Gerbėjai taip pat gali pastebėti, kad policijos automobiliai ir kitos greitosios pagalbos automobiliai atrodo daug panašesni į jų realaus gyvenimo kolegas Niujorke. GTA III po tragiškų įvykių arba rugsėjo 11-osios sulaukė tam tikrų vizualinių pokyčių. Vienas iš šių pakeitimų buvo tas, kad policijos automobiliai tapo juodai balti, o ne mėlynai balti patrulių automobiliai, kurie buvo rasti Niujorke ir matomi ankstyvose ekrano kopijose arba GTA III. Claude'as, tylus veikėjas arba GTA III, atrodo labai skirtingai. Kaip pažymėjo GTA forumų vartotojas 3li0507, „Rockstar“ patyrė daugybę skirtingų Claude'o žvilgsnių, todėl vienu metu jis atrodė tikrai išblyškęs. Komanda ar modifikatoriai ne tik vizualiai pakeičia GTA III šiam ritiniui, bet ir redaguoja tai, kaip elgiamasi su automobiliais, keičia žaidimo pojūtį ir susimaišo su kitais elementais ar GTA III. Galutinis rezultatas yra žaidimas, kuris atrodo tarsi išmestas iš alternatyvios visatos.
